La COEPES es un organismo público desconcentrado de la Secretaria, coordinada de forma directa por el titular de la misma, integrado por personal adscrito y de la propia Secretaria, cuyo objetivo es planear y proponer políticas públicas para el fortalecimiento y desarrollo coordinado de la educación superior en el Estado. Para el cumplimiento de sus funciones participaran todas las instituciones de educación superior públicas y privadas en la Entidad.

En cuanto organismo desconcentrado, contara con facultades especificas para resolver los asuntos de su competencia establecidos tanto en la presente Ley como en su reglamento, con autonomía de gestión y decisión en sus funciones. La COEPES contara financieramente con los recursos necesarios para el desarrollo de sus funciones, los cuales estarán contemplados dentro del presupuesto determinado anualmente para la Secretaria.